From 06808d89656131a5730623040e2666315e6d1058 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Roman Krivonos <krivonos@cosmos.ru>
Date: Fri, 10 Oct 2025 15:59:24 +0300
Subject: [PATCH] ReadMe

---
 arches/arches/config.py |  2 +-
 arches/arches/utils.py  | 28 +++++++++++++++++++---------
 scripts/README.md       | 18 +++++++++++++++---
 3 files changed, 35 insertions(+), 13 deletions(-)

diff --git a/arches/arches/config.py b/arches/arches/config.py
index 1d41121..762a4c3 100644
--- a/arches/arches/config.py
+++ b/arches/arches/config.py
@@ -8,7 +8,7 @@ det_pix_as=0.05
 """ Arches core R=15 arcsec """
 arches_ra=266.4595833
 arches_dec=-28.8219444
-arches_Rmax_as=15
+arches_Rmax_as=130
 
 pn_threshold = 0.2
 mos_threshold=[0.2,0.3]
diff --git a/arches/arches/utils.py b/arches/arches/utils.py
index 0b66d2e..1635b88 100644
--- a/arches/arches/utils.py
+++ b/arches/arches/utils.py
@@ -108,7 +108,7 @@ def plotLC(plt,threshold,fileName):
     else:
         print("File not found "+fileName+"\n")
         
-def init_work_dir(obsid):
+def init_work_dir(obsid,products_dir=None):
 
     import arches
 
@@ -117,7 +117,6 @@ def init_work_dir(obsid):
 
     archive_dir=root_path+'/data/archive'
     events_dir=root_path+'/data/processed'
-    products_dir=root_path+'/products'
     ds9reg_dir=root_path+'/data/ds9reg'
 
     create_folder(products_dir)
@@ -175,7 +174,7 @@ def get_det_coords(ra,dec,image,key):
                 dety=float(dy)
     return detx,dety
 
-def run_mosspectra(key,ccds,check=True):
+def run_mosspectra(key,ccds,check=True,elow="350",ehigh="1100"):
 
     eventfile = f'{key}-allevc.fits'
     
@@ -217,13 +216,24 @@ def run_mosspectra(key,ccds,check=True):
               'withregion=yes', f'regionfile={region_fn}',
               'keepinterfiles=yes',
               'pattern=12',
-              'elow=350',
-              'ehigh=1100',
+              f'elow={elow}',
+              f'ehigh={ehigh}',
               f'ccds="{ccds}"',]
 
     w('mosspectra', inargs).run()
+    
 
-def run_pnspectra(key,quads,check=True):
+def run_bkgimsky(key,elow="350",ehigh="1100"):
+    # convert background image in det coordinates (e.g. mos1S001-bkgimdet-350-1100.fits) to sky coordinates
+    # runs after mosback!
+    bkgimsky = f'{key}-bkgimdet-{elow}-{ehigh}.fits'
+    inargs = [f'intemplate={key}-fovimsky-{elow}-{ehigh}.fits',
+            f'inimage={key}-bkgimdet-{elow}-{ehigh}.fits',
+            f'outimage={key}-bkgimsky-{elow}-{ehigh}.fits',
+            'withdetxy=false', 'withskyxy=false',]
+    w('rotdet2sky', inargs).run()
+
+def run_pnspectra(key,quads,check=True,elow="350",ehigh="1100"):
     eventfile = f'{key}-allevc.fits'
 
     (detx,dety)=get_det_coords(arches_ra,arches_dec,f'{key}-fovimt.fits',key)
@@ -265,8 +275,8 @@ def run_pnspectra(key,quads,check=True):
               f'regionfile={region_fn}',
               'keepinterfiles=yes',
               'pattern=0',
-              'elow=350',
-              'ehigh=1100',
+              f'elow={elow}',
+              f'ehigh={ehigh}',
               f'quads="{quads}"',]
 
     w('pnspectra', inargs, ).run()
@@ -319,6 +329,6 @@ def group_spectrum(key=None, group_min=25, oot=False):
     fxcm.write('ign bad\n')
     fxcm.write('cpd /xs\n')
     fxcm.write('setpl en\n')
-    fxcm.write('@../../data/xspec/wabs_apec_cflux.xcm\n')
+    fxcm.write('@../../../data/xspec/wabs_apec_cflux.xcm\n')
     fxcm.write('pl lda delchi\n')
     fxcm.close()
diff --git a/scripts/README.md b/scripts/README.md
index 91ff4cd..be1bf51 100644
--- a/scripts/README.md
+++ b/scripts/README.md
@@ -1,9 +1,21 @@
+Вне зависимости от того, будет запускаться SAS или ESAS, необходимо запустить первую команду:
 
 ### 01_init_events.py
 
 Создает списки событий и помещает их в ```arches/data/processed```
-Оригинальные файлы со списками событий задаются в файлах ```uds/data/evtlists/*.txt```
+Оригинальные файлы со списками событий задаются в файлах ```arches/data/archive```
 
-### 02_merge_events.py
+## ESAS
+
+### 02_esas_image.py
+
+### 03_esas_cheese.py
+
+### 04_esas_spectra.py
+
+Запускает [mos,pn]spectra/[mos,pn]back 
+
+### 05_esas_group_spectra.py
+
+Делает групировку спектров
 
-Создает объедененный список событий и помещает его в ```uds/products```. Этот список событий нужен, в основном для извлечения спектров с помощью ```srctool```.